Управление МБУДО ДШИ № 16 осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации и Уставом образовательной организации. Согласно Федерального Закона «Об образовании в Российской Федерации» от 29 декабря 2012 № 273-ФЗ (ч. 2 ст. 26) управление школой осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
Единоличным исполнительным органом МБУДО ДШИ № 16 является руководитель учреждения — директор, Ракова Татьяна Витальевна, тел. (+7(383) 216-41-20;
Заместитель директора (по учебной работе) Иванова Марина Ивановна;
Заместитель директора (по внеклассной и конкурсно-фестивальной работе) Лесниченко Анастасия Павловна.
Главный бухгалтер — Супрунова Анна Андреевна (+7 (383) 226-67-21)
Ведущий бухгалтер — Тимкина Татьяна Сергеевна (+7 (383) 226-67-21)
Заведующий хозяйством — Резниченко Валентина Михайловна (+7 (383) 216-35-54)
E-mail: dshi16d@mail.ru
Коллегиальными органами управления МБУДО ДШИ № 16 являются:
Общее собрание работников
Педагогический совет (п. 4.6. Устава школы)

